Program Studi S2 Ilmu Kesehatan Masyarakat adalah salah satu program studi magister dari enam program studi magister yang dikelola oleh Fakultas Kesehatan Masyarakat, Universitas Hasanuddin (Unhas). Program studi ini berdiri pada tahun 1999 berdasarkan Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan dan Kebudayaan saat itu (Kementerian Pendidikan Nasional saat ini) bernomor 115/DIKTI/Kep/1999 tertanggal 5 Maret 1999, tentang Pembentukan Program Studi Magister Ilmu Kesehatan Masyarakat padaProgram Pascasarjana di Lingkungan Universitas Hasanuddin Makassar.

Pada awal mendapatkan izin operasional di tahun 1999, Program Studi Magister   Ilmu Kesehatan Masyarakat terdiri dari konsentrasi Administrasi dan Kebijakan Kesehatan, Gizi Kesehatan Masyarakat dan Kesehatan Lingkungan. Kemudian berkembang dengan mengelola tujuh konsentrasi, yaitu Administrasi dan Kebijakan Kesehatan, Gizi Kesehatan Masyarakat dan Kesehatan Lingkungan, Promosi Kesehatan, Kesehatan dan Keselamatan Kerja (K3), Manajemen Rumah Sakit (MRS) dan Kesehatan Reproduksi dan Keluarga. Selanjutnya terjadi perkembangan, beberapa konsentrasi berkembang menjadi program studi. Yang pertama mengajukan perubahan menjadi program studi adalah Konsentrasi MRS, yaitu pada tahun 2019, menyusul konsentrasi K3 pada tahun 2020, selanjutnya tahun 2021 Konsentrasi AKK, KL dan Gizi, sehingga saat ini Program Studi Magister Ilmu Kesehatan Masyarakat hanya mengelola tiga konsentrasi, yaitu Epidemiologi, Promosi Kesehatan, dan Kesehatan Reproduksi dan Keluarga.

Program studi ini beralamat di Kampus Unhas Tamalanrea Jl. Perintis Kemerdekaan Km.10 Makassar. Sejak tahun 1999, program studi S2 Kesehatan Masyarakat telah tiga kali mengajukan Borang akreditasi, yaitu pada tahun 2012, 2016 dan terakhir 2022. Akreditasi pertama yang diajukan pada tahun 2012, berdasarkan Keputusan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) No. 006/BAN-PT/Ak-X/S2/VI/2012 tanggal 15 Juni 2012 menyatakan bahwa Program Studi Magister Ilmu Kesehatan Masyarakat Universitas Hasanuddin terakreditasi dengan peringkat Akreditasi A, selanjutnya pada tahun 2017 oleh Perkumpulan Lembaga Akreditasi  Mandiri  Pendidikan Tinggi  Kesehatan  Indonesia  (LAM- PTKes Nomor: 0532/LAM-PTKes/Akr/Mag/VIII/2017 Tanggal 26 Agustus 2017 dengan peringkat Akreditasi A dan terakhir juga dari LAM-PTKes dengan Nomor: 1061/LAM-PT- Kes/Akr/Mag/XII/2022 Tanggal 16 Desember 2022 menyatakan bahwa Program Studi Magister Ilmu Kesehatan Masyarakat Terakreditasi Unggul.